表題番号:2021C-215 日付:2022/06/08
研究課題長鎖ノンコーディングRNA情報解析基盤の開発
研究者所属(当時) 資格 氏名
(代表者) 理工学術院 先進理工学部 教授 浜田 道昭
研究成果概要
長鎖ノンコーディングRNA(lncRNA)は生体内で単独で機能を発揮しているわけではなく,他の機能性分子と相互作用を行うことにより様々な機能を実現している.今年度はlncRNAと相互作用するRNA結合タンパク質(RBP)を情報科学的に解析するための研究を複数行った.第一に,RBPに結合するRNA配列をBERTの事前学習モデルを用いて予測するRBP-BERTを開発した.さらに学習された結果を解析することによりRBP結合の生物学的な特徴を抽出した.第二に,トランスポゾンなどのリピート要素に結合するRBPの網羅的な解析を行った.これにより,リピート要素がRBP結合の機能性配列となっていることが明らかになった.