表題番号:2021C-199 日付:2022/06/12
研究課題回転分子モーターの動作機構解析
研究者所属(当時) 資格 氏名
(代表者) 理工学術院 先進理工学部 教授 高野 光則
研究成果概要
回転分子モーターの回転機構を分子動力学シミュレーションとアンブレラサンプリングによって解析した。分子内部の水チャネルの形成ダイナミクスとイオンの流入、および回転機構の鍵を握る分子内のプロトン移動と高度に保存されたc-ring上の酸性アミノ酸におけるプロトン脱着のタイミングを解析した。そのために回転角を反応座標にとったアンブレラサンプリングを行い、自由エネルギー地形を求めた。さらに、サンプリングで得られた熱平衡化された複数の代表構造を用いてプロトン脱着機構と回転機構の解析を行った。