表題番号：2020C-275 日付：2021/11/14
研究課題GBSAモデルの改良と局所誘電率解析
研究者所属（当時） 資格 氏名
（代表者） 理工学術院 先進理工学部 教授 高野　光則
研究成果概要
Generalized Bornモデル（GB）モデルは水を誘電体として扱うことで電荷間のクーロン相互作用を高速に計算できるモデルである。非クーロン相互作用（ファンデルワールス相互作用と疎水性相互作用）も分子間相互作用に寄与し、これを高速に計算する溶媒露出表面積（SA）モデルとGBモデルとをあわせたGBSAモデルに広く用いられている。昨年度の研究でSAモデルのエネルギー・パラメータ（単位面積あたりのエネルギー値）が負値をとることを示したが、本年度はキネシン－微小管系を用いてSAモデルのエネルギー・パラメータが取り得る範囲を調査し、あわせてGBモデルにおけるエネルギー密度積分のカットオフ・パラメータの影響を調査した。